Deutsches R-Forum

Verfasst: **Do Nov 29, 2018 2:52 pm**

Ich möchte Messwerte, die in xml-Dokumenten hinterlegt sind, zu einem Zahlenvektor zusammenfassen, um dann z.B. einen Mittelwert zu berechnen etc. Hier ein Beispiel XML-Dokument, welches ich doku.xml genannt habe:

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<meinDokumentInXML>
<Information>
<ErsteInformation> hier </ErsteInformation>
<ZweiteInformation> da </ZweiteInformation>
</Information>
<Messwerte>
<ErsterMesswert>10</ErsterMesswert>
<ZweiterMesswert>20</ZweiterMesswert>
</Messwerte>
</meinDokumentInXML>

Um das Dokument in R zu importieren und die Daten bearbeiten zu können, verwende ich folgende Packages:

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> install.packages("XML")
> library("XML")
> library("methods")

Ich importiere doku.xml mit:

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> xml_doku<-xmlParse(file="doku.xml")

Um die "root node form" des xml-Dokumentes in R nutzen zu können, mache ich Folgendes:

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> doku <- xmlRoot(xml_doku)

Nun kann ich mir den 1. Messwert anzeigen lassen mit:

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> doku[[2]][[1]][[1]]
10

Den 2. Messwert erhalte ich mit:

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> doku[[2]][[2]][[1]]
20

Dann dachte ich, könnte ich die Messwerte auch zu einem Messwerte-Vektor zusammenfassen. (Im wahren Leben stehen die Messwerte bei mir in vielen verschiedenen xml-Datein). Ich habe folgenden Befehl verwendet, was R ohne zu meckern ausführt:

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> vektor_Messwerte<-c(doku[[2]][[1]][[1]], doku[[2]][[2]][[1]])

Allerdings hat der Vektor dann folgende Struktur:

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> vektor_Messwerte
[[1]]
10 

[[2]]
20

Und wenn ich den Mittelwert berechnen möchte, erscheint Folgendes:

> mean(vektor_Messwerte)
[1] NA
Warnmeldung:
In mean.default(vektor_Messwerte) :
Argument ist weder numerisch noch boolesch: gebe NA zurück

Ich hätte gern einen Vektor, der folgende Struktur hat:

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> vektor_Zahl<-c(10,20)
> vektor_Zahl
[1] 10 20

Wenn ich da z.B. den Mittelwert berechnen will, geht das folgerichtig mit

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> mean(vektor_Zahl)
[1] 15

Ehrlich gesagt verstehe ich nicht, warum R bei dem Befehl > c() eine andere Struktur im Vektor anlegt, wenn ich einen Pfad des Messwertes nenne. Wenn ich dagegen die Zahlen, die zum Vektor zusammengefasst werden sollen, direkt schreibe, erscheint ein normaler Zahlenvektor...

V.a. interessiert mich aber eine Lösung meines Problems...
Vielen Dank

Verfasst: **Fr Nov 30, 2018 12:34 pm**

R_Forscher hat geschrieben: Do Nov 29, 2018 2:52 pmAllerdings hat der Vektor dann folgende Struktur:
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> vektor_Messwerte
[[1]]
10 

[[2]]
20 

Das ist kein Vektor, das ist eine Liste. Die kann man mit unlist() in einen Vektor verwandeln

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> list(10,20)
[[1]]
[1] 10

[[2]]
[1] 20

> unlist(list(10,20))
[1] 10 20

> mean(unlist(list(10,20)))
[1] 15

LG,
Bernhard

Verfasst: **Sa Dez 01, 2018 12:17 am**

Taugt dir das was?

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xml <- '<meinDokumentInXML>
  <Information>
  <ErsteInformation> hier </ErsteInformation>
  <ZweiteInformation> da </ZweiteInformation>
  </Information>
  <Messwerte>
  <ErsterMesswert>10</ErsterMesswert>
  <ZweiterMesswert>20</ZweiterMesswert>
  </Messwerte>
  </meinDokumentInXML>'

library(xml2)
doc <- read_xml(xml)
xml_double(xml_find_all(doc, '//Messwerte/child::*'))

xpath ist eleganter als solche konstrukte: doku[[2]][[1]][[1]] Vorallem bei komplexeren xmls...

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Zahlenvektor aus xml-Dokumenten

Zahlenvektor aus xml-Dokumenten

Re: Zahlenvektor aus xml-Dokumenten

Re: Zahlenvektor aus xml-Dokumenten